こんばんは、やっと戻ってきました。
＞655×480で切り取りしたものはデジカメ、スキャン画像かかわらず、チェックを外したほうがいいのでしょうか？
「フレームサイズに合わせる」のチェックを外してください。
後でレンダリングのことを説明しますが、チェックを外すとレンダリングが行われません。レンダリングが行なわれると「解凍→合成→再圧縮」の工程が入り、多少なりとも画質劣化が起こります。レ ンダリング不要なら画質劣化は起こりません。
＞チェックを外すと何も色が付きません。これはそのまま書き出ししても問題ないでしょうか。
問題ありません。
レンダリングバーに色が付かないことは、レンダリング不要と言うことです。レンダリング不要なら最良です。
まずは質問にお答えしました。
いいところに気が付きましたね。
このあとレンダリングについて補足書き込みをします。