こんばんは、horaiyeさん
質問①
＞いつも「MST-H264 １４４０×１０８０i 25」になっています。
プリセットはドロップダウンリストを開いて、「M2T- H.264 1440×1080i 30」を選択しましたよね。
ちゃんと選択できていれば、「M2T- H.264 1440×1080i 25」になることはないと思いますが。
改善できない場合、「M2T- H.264 1440×1080i 25」になっているのをどこの画面（段階）で確認できたか教えてください。スクリーンショットを添付して頂ければ助かります。
質問②
＞DVDに一端切り替えなくてもBD盤がセットされているように認識されるようにはどうしたら良いでしょう？
「書き出し・配信」または次の画面の「ディスク」をクリックする前に、ディスクをセットすればこの警告メッセージは出ません。
このメーッセージが表示されていても、ディスクをセットし、「再スキャン」をクリックするとステータスは「準備完了」に変わります。